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            擴增子測序

            來源: 本站原創    作者:佚名   發布時間:2015/3/31 11:51:24

             擴增子測序是對特定長度的PCR產物或者捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。擴增子測序能夠根據不同需求,對目標區域進行高覆蓋度的測序,還可以檢測到低頻突變。目前擴增子測序主要包括針對功能基因的測序、靶向序列定向捕獲片段的測序和甲基化片段測序等類型。 

            一、技術路線

            Illumina MiSeq   Roche 454 FLX+

            二、生物信息分析

             

            1. 原始數據整理、過濾及質量評估 

             

            2. 序列比對與分析:
                ♦與參考序列比對
                  ♦SNPs和InDel的檢測

             

            3. 根據客戶需求進行個性化分析

             

            三、結果展示

             

              

             

            四、樣品要求

             

            1.請您提供Nanodrop、Gel-Electrophotometric或者Agilent中一種或多種形式的樣品分析結果。

             

            2.樣品純度要求:OD值應在1.82.0之間;電泳檢測無明顯非特異性雜帶,PCR產物條帶清晰、完整。

             

            3.樣品濃度:純化后PCR產物濃度不低于5 ng/ul。

             

            4.樣品總量:樣品總量不低于200 ng。

             

            5.樣品信息:請仔細填寫DNA樣品信息表,提供DNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源。請同時附上QC數據,包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數據。 如需進行多次樣品制備,需要提供多次樣品制備所需樣品。

             

            6.送樣管務必標清樣品編號,管口使用Parafilm膜密封。

             

            7.寄送樣品需要保持低溫環境,最好的方法是凍干郵寄,其次是溶于TE,當然也可以溶于雙蒸水。

             

            五、迪巧的優勢

             

            1.迪巧生物擁有多個高通量測序平臺,其中Illumina MiSeq平臺具有讀長長,速度快,靈活性強,尤其適合于擴增子測序,可以保證數據的準確性以及變異位點的發現。

             

            2.可定制個性化的測序及分析方案,根據實際客戶需求,深度定制方案。

          2. 上一個項目: SSR分子標記開發
          3. 下一個項目: 沒有了
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