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            線粒體基因組測序

            來源: 本站原創    作者:佚名   發布時間:2015/3/30 16:08:03

            線粒體是真核細胞進行氧化磷酸化的場所,主要功能是提供細胞所需要的能量,線粒體擁有自身的DNA和遺傳體系,mtDNA的突變會導致一些疾病的產生,同時與生物進化及細胞起源有很密切關系,目前mtDNA 已被廣泛用于系統發育重建、譜系生物地理學、群體結構及動態和基因組水平分子進化等領域的研究。


             一、技術路線

                             

             


             二、生物信息分析

            1、標準服務:
            提供一份線粒體基因組全長序列文件(對測序數據進行組裝、去除冗余序列、序列調零)。
            2
            、升級服務:
            基因組基本分析:基因組大小、基因注釋、密碼子使用統計等
            tRNA 
            ,rRNA 二級結構預測;
            系統發育樹重構;
            序列上傳;
            其他個性化分析


            三、結果示例

              

            線粒體基因組結構圖                          rRNA二級結構預測


                        系統發育樹構建


            四、樣品要求

            1、樣品采集:鑒于線粒體在不同組織中的含量差異大,建議采樣時盡量采集線粒體含量相對較高的組織,比如肌肉組織等。 
            2
            、樣品DNA:提供濃度≥50ng/ul,總量≥5ug,并確保電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整。組織樣品>1.5g
            3
            、樣品保存期間切勿反復凍融。
            4
            、送樣務必標清樣品編號,管口用Parafilm膜密封。

             

          2. 上一個項目: 微衛星(STR)分析服務
          3. 下一個項目: 實時熒光定量PCR技術服務
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